A DC caracteriza-se por uma grande variedade de sintomas e de sinais. Pode atingir o organismo de forma multissistémica (envolvendo muitos órgãos e sistemas) ou, no outro extremo, de forma mono ou oligo-sintomática (com uma ou outra queixa, por vezes muito ligeiras).

Os sintomas mais comuns da DC variam conforme a idade, sendo que, dentro de cada faixa etária, podem também variar em frequência e intensidade.

Assim, é habitual dividir as manifestações da DC em dois grupos: os doentes com sintomas clássicos (geralmente crianças com diarreia, flatulência, distensão abdominal, cólicas abdominais, gorgolejo, emagrecimento, desnutrição ou atraso decrescimento) e os doentes com sintomas atípicos – geralmente adultos com sintomas extra-intestinais (anemia ferropénica (por falta de ferro e resistente à terapêutica habitual); osteopénia/osteoporose marcadas e/ou precoces; dermatite herpetiforme; estomatite aftosa recorrente; infertilidade e abortos recorrentes; alterações neurológicas e psiquiátricas; alterações na função da tiróide; alterações nas análises hepáticas; alterações na dentição definitiva: hipoplasia do esmalte).